La muestra de orina de "toma limpia" se lleva a cabo recogiendo la orina a mitad del chorro. Los hombres y los niños deben limpiarse la cabeza del pene. Las mujeres y las niñas deben lavar el área entre los labios de la vagina con agua jabonosa y enjuagarla bien. Se debe dejar caer en el inodoro una pequeña cantidad de orina antes de tomar la muestra (esto elimina de la uretra elementos contaminantes). Luego, se recoge de 1 a 2 onzas de orina en un recipiente limpio que posteriormente se aparta del chorro de orina. Éste se le entrega al personal médico.